蛋白質(zhì)芯片是一種高通量的蛋白功能分析技術(shù)，可用于蛋白質(zhì)表達譜分析，研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用，甚至DNA－蛋白質(zhì)、RNA－蛋白質(zhì)的相互作用，篩選藥物作用的蛋白靶點等。

在蛋白質(zhì)分析技術(shù)中，蛋白質(zhì)芯片是一種高通量、微型化和自動化的新型分析手段 。目前蛋白質(zhì)芯片主要分兩種：一種類似于 DNA 芯片，即在固相支持物表面高密度排列的探針蛋白點陣，可特異地捕獲樣品中的靶蛋白，然后通過檢測器對靶蛋白進行定性或定量分析；另一種就是微流控電泳芯片，通過在玻璃片或硅片上設(shè)置各種微泵、微閥、微電泳以及微流路，可將生化實驗室的分析功能濃縮固化在蛋白質(zhì)芯片上，然后在電場作用下，樣品中的蛋白質(zhì)通過芯片上的孔道分離開來，經(jīng)噴霧直接進入質(zhì)譜儀中進行檢測，以確定樣品中蛋白質(zhì)的分子量及種類。

蛋白質(zhì)芯片將為生物化學(xué)和分子生物學(xué)提供強有力的分析工具。相對于 DNA 芯片，蛋白質(zhì)芯片的研究進展顯得相對滯后，主要原因是 ：（1）芯片材料表面的修飾方法尚不成熟；（2）樣品制備和標記操作過于繁瑣；（3）信號檢測靈敏度低，如低拷貝蛋白質(zhì)的檢測和難溶蛋白的檢測精度更加難以保證，因此需要研制和開發(fā)高度集成化樣品制備及檢測儀器。這些問題不僅為蛋白質(zhì)芯片技術(shù)增加了難度，同時也是蛋白質(zhì)芯片能否從實驗室推向臨床應(yīng)用的關(guān)鍵所在。