至今細(xì)菌鑒定,檢驗(yàn)的方法有三大類:傳統(tǒng)方法,傳統(tǒng)法基礎(chǔ)上的數(shù)值化方法,化學(xué)及分子生物學(xué)的方法.每一類派生出幾種方法及檢驗(yàn)儀器.我國(guó)以往多用傳統(tǒng)的方法,俗稱培養(yǎng)法,即細(xì)菌培養(yǎng)后根據(jù)鏡檢其形態(tài)特征和分析其生理代謝特征檢驗(yàn)細(xì)菌.近幾年業(yè),我國(guó)已大量引進(jìn)國(guó)外20世紀(jì)90年代以后推出的新方法和儀器,應(yīng)有和較廣的是:
       (1) 根據(jù)不同細(xì)菌對(duì)不同碳源的利用率進(jìn)行自動(dòng)鑒定和檢驗(yàn)，這屬于數(shù)值化方法和儀器，如APL、ATB、VITEK、等系統(tǒng)。
       (2) 利用抗原和抗體間專一性結(jié)合、免疫反應(yīng)，進(jìn)行的致病菌檢驗(yàn)，其中以酶聯(lián)熒光免疫分析（ELFIA）為代表，如VIDAS系統(tǒng)。
       (3) 運(yùn)用基因檢測(cè)技術(shù)檢測(cè)病原菌，如杜邦公司開發(fā)的BAX系統(tǒng)可用于進(jìn)行均種鑒定、分型，RP（Ridopvinter）系統(tǒng)用于溯源。
       (4) 根據(jù)不同細(xì)菌都具有特征性的脂肪酸圖譜進(jìn)行細(xì)菌鑒定。
       (5) 基于表面等離子諧振（SPR）生物傳感器開發(fā)的致病菌檢驗(yàn)系統(tǒng)，如Biacore系統(tǒng)。
       (6) 基于生物芯片為平臺(tái)，使用致病菌檢測(cè)試劑盒，檢測(cè)致病菌的系統(tǒng)的生物芯片檢測(cè)系統(tǒng)。     
       致病菌檢驗(yàn)和細(xì)菌自動(dòng)鑒定系統(tǒng)的國(guó)外著名生產(chǎn)廠家為Biomerieux、Dupont、Agilant、Biologe、GEHeailhcare和Biacore 等；

       國(guó)內(nèi)以往尚無(wú)正式生產(chǎn)廠家，只有抑菌圈測(cè)定儀的廠家，這是一個(gè)極大的缺陷。需知從世界范圍講，致病菌引發(fā)的食品中毒案例，是食品安全中的首位，所以期待著有更多的國(guó)產(chǎn)儀器推出、并占領(lǐng)這一巨大的市場(chǎng)。