全球首個生物芯片產(chǎn)品問世雖然已有20多年的時間，但生物芯片分類方式仍沒有完全統(tǒng)一的標準。比較常見的分類方式有3種，分別是按用途、作用方式和成分來分類。

（1）用途分類

生物電子芯片：用于生物計算機等生物電子產(chǎn)品的制造。

生物分析芯片：用于各種生物大分子、細胞、組織的操作以及生物化學反應(yīng)的檢測。生物電子芯片目前在技術(shù)和應(yīng)用上并不十分成熟，一般情況下所指的生物芯片主要為生物分析芯片。

（2）作用方式分類

主動式芯片：是指把生物實驗中的樣本處理純化、反應(yīng)標記及檢測等多個實驗步驟集成，通過一步反應(yīng)就可主動完成。 特點是快速、操作簡單，因此有人又將它稱為功能生物芯片。主要包括微流體芯片（microfluidic chip）和縮微芯片實驗室（lab on chip，也叫“芯片實驗室”，是生物芯片技術(shù)的高境界）。

被動式芯片：即各種微陣列芯片，是指把生物實驗中的多個實驗集成，但操作步驟不變。 其特點是高度的并行性，目前的大部分芯片屬于此類。由于這類芯片主要是獲得大量的生物大分子信息，最終通過生物信息學進行數(shù)據(jù)挖掘分析，因此這類芯片又稱為信息生物芯片。包括基因芯片、蛋白芯片、細胞芯片和組織芯片。

（3）成分分類

基因芯片（genechip）：又稱DNA芯片（DNA chip）或DNA微陣列（DNA microarray），是將cDNA或寡核苷酸按微陣列方式固定在微型載體上制成。

蛋白質(zhì)芯片（proteinchip或protein microarray）：是將蛋白質(zhì)或抗原等一些非核酸生命物質(zhì)按微陣列方式固定在微型載體上獲得。芯片上的探針構(gòu)成為蛋白質(zhì)或芯片作用對象為蛋白質(zhì)者統(tǒng)稱為蛋白質(zhì)芯片。

細胞芯片（cellchip）：是將細胞按照特定的方式固定在載體上，用來檢測細胞間相互影響或相互作用。

組織芯片（Tissuechip）：是將組織切片等按照特定的方式固定在載體上，用來進行免疫組織化學等組織內(nèi)成分差異研究。

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