前轉(zhuǎn)基因的檢測(cè)方法轉(zhuǎn)基因作物檢測(cè)方法大體分為兩種：一是檢測(cè)是否含有外源蛋白，即外源基因表達(dá)產(chǎn)物，主要采用酶聯(lián)免疫吸附法和試紙條法;二是檢測(cè) 是否含有外源基因(DNA)，主要有Southern雜交技術(shù)、基因芯片法和PCR檢測(cè)法。理論上來說，以上所介紹的轉(zhuǎn)基因檢測(cè)方法，只要改變相應(yīng)的檢測(cè) 靶標(biāo)，都可檢測(cè)不同的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品。

       但是實(shí)際應(yīng)用中，以檢測(cè)外源蛋白的轉(zhuǎn)基因檢測(cè)方法存大很大的局限性，食品的復(fù)雜成分會(huì)干擾檢測(cè)效果，并且加工過的轉(zhuǎn)基因食品中的蛋白質(zhì)抗原性很容易受 破壞，從而會(huì)影響檢測(cè)結(jié)果的靈敏度。此外，該方法需要大量的抗體和抗原。目前，商品化的ELISA檢測(cè)試劑盒和膠體金試紙條只能檢測(cè)少數(shù)幾種轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品， 且一種試劑盒或試紙條只能針對(duì)某一特定轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物，不能針對(duì)多種混合成分的食品樣品進(jìn)行檢測(cè)。

       基因水平的檢測(cè)方法具有適用范圍廣的優(yōu)勢(shì)，只要樣品中有DNA存在，就能被檢測(cè)，不受食品混合、復(fù)雜成分的干擾，適用于轉(zhuǎn)基因原料、初加工和深加工食品的檢測(cè)，而且有很好的特異性和靈敏度，已經(jīng)發(fā)展為常用的轉(zhuǎn)基因食品檢測(cè)方法。